使用多样本基因丰度表和样本分组信息绘制的Circos圈图,主要应用于基因组学和微生物群落分析领域。通过可视化不同样本间基因或物种的丰度、相似性及相互关系,有助于揭示群体结构、种群变化以及潜在的生态规律。Circos图表通过环形布局同时展示多种类型的信息,特别适用于呈现复杂、跨样本的基因组或群落数据关系。
输入文件
基因丰度表
一个包含行列名称的制表符分隔文本文件,每列代表一个样本,每行代表一个基因(基因名称具有唯一性且不可重复)。

分组信息表
一个包含行列名称的制表符分隔文本文件,列名固定为(SampleID, Category)。第一列为样本名称,第二列为该样本对应的分组信息。

输出

内圈中,左侧每个扇形区域代表一个基因,右侧每个扇形区域代表一个分组。各扇形区域与外圈通过颜色对应,内部线条的宽度表示比例。
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Q1. 数据文件名称有没有要求?
OmicShare当前支持文件命名为中文、英文、符号仅支持英文点号“.”及下划线"_"。 不支持空格及其他特殊符号.
Q2. 提交时报错常见问题:
1. 提交时显示X行X列空行/无数据,请先自查表格中是否存在空格或空行,需要删掉。
2. 提交时显示列数只有1列,但表格数据不止1列:列间需要用分隔符隔开,先行检查文件是否用了分隔符。