脑膜炎奈瑟菌属于变形菌门β-亚群革兰氏阴性球菌，1887年Weichselbaum首次从脑膜炎患者的脑脊液中分离。脑膜炎奈瑟菌极少致病，但可引起侵袭性脑膜炎球菌病（IMD）。脑膜炎奈瑟菌通常定植于人的鼻咽部上皮组织，并通过气溶胶飞沫或与受感染的液体（如唾液）接触传播。当脑膜炎球菌穿过鼻咽部上皮组织进入血液时，就会引发IMD，导致败血症和/或脑膜炎的快速发作。
MLST最初为脑膜炎球菌开发，现在已广泛应用于细菌病原体的分型。脑膜炎球菌MLST分型方案根据7个管家基因abcZ、adk、aroE、fumC、gdh、pdhC、pgm的等位基因，将菌株划分为不同的序列类型。共享4个或更多等位基因的ST型被归类为一个克隆复合体，并以假定的“祖先”ST型命名。最早的血清分型方案基于细菌表面多糖荚膜与免疫血清的凝集反应，依据这种分型方法共定义了13种脑膜炎球菌血清型（A、B、C、D、E、H、I、K、L、W、X、Y和Z），其中A、B、C、W、X、Y这六个血清型菌株是引起人类疾病的主要病原体，同时这些致病菌又可进一步归属于11个克隆复合体（cc1、cc4/5、cc8、cc11、cc18、cc32、cc41/44、cc103、cc269、cc334 和 cc461）。这些克隆复合体因具有高侵袭性或高毒力特征被称为高侵袭性谱系。在流行病学监测中，高侵袭性谱系常和疾病发生存在强关联性，而像cc53这样的谱系则仅表现为无症状携带状态。此外，部分谱系如cc22、cc23、cc60、cc162、cc174、cc213、cc364和cc4821与疾病发生的关联强度相对较弱。
β-内酰胺类抗生素（包括青霉素、氨苄西林和头孢曲松）、氟喹诺酮类药物（如环丙沙星）和氯霉素均被用作IMD的经验性治疗，其中头孢曲松常是首选抗生素。IMD的治疗通常不会导致耐药变异的传播。
疫苗接种是预防和控制IMD的主要手段。常用的脑膜炎球菌疫苗有两种：多糖结合疫苗，其中覆盖MenACWY的四价疫苗最常用（商品名Nimenrix、Menactra和Menveo）；以及基于外膜囊泡的多价蛋白疫苗（商品名Bexsero和Trumenba）。
脑膜炎球菌最重要的毒力因子与其在口咽部的定植有关，包括免疫球蛋白A1（IgA1）蛋白酶、抗吞噬多糖荚膜以及一系列能与上皮结合的细菌粘附素。IgA1蛋白酶是一种位点特异性丝氨酸蛋白酶。它在铰链区裂解抗体分子，分离Fab和Fc区，从而防止病原体被粘液纤毛清除，促进其附着在呼吸道上皮中。除了对抗吞噬作用外，脑膜炎奈瑟菌的多糖荚膜可排斥粘液，阻碍粘液纤毛的清除。
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