乙型流感病毒（Influenza B virus，IBV）属于正粘病毒科（Orthomyxoviridae），是一种能够引起人类呼吸道疾病的重要病原体。该病毒于1940年首次从临床患者中被分离鉴定，儿童和老年人是其主要的易感人群。与甲型流感病毒相比，IBV过去常被认为引发的临床症状相对较轻、抗原特异性较低、且很少引起大规模流行性疾病，因此往往不被重视。近年来研究表明，IBV造成的危害程度几乎与甲型流感病毒相当，每年全球流感相关疾病负担的三分之一均可归因于IBV感染。
IBV基因组包括8个分节段的单股负链RNA，这些RNA编码至少11个蛋白质，包括多聚合酶（PB2、PB1、PA）、血凝素（HA）、核蛋白（NP）、神经氨酸酶（NA与NB）、基质蛋白（M1与BM2）和非结构蛋白（NS1和NS2) 。其中NB和NA是乙型流感病毒的特有蛋白质。
IBV不区分亚型，而是根据抗原特性和HA基因的核苷酸序列分为两大谱系：B/Victoria/2/87-like（B/Victoria）和B/Yamagata/16/88-like（B/Yamagata）。从2002年起，这两个谱系的病毒在世界范围内共同流行。目前，两个谱系间的重配模式存在差异，且重配与IBV的相对遗传多样性之间存在相关性。抗原分析结果显示，B/Yamagata谱系比B/Victoria具有更高的遗传多样性，这可能导致感染某种B/Yamagata谱系病毒株的患者对同种谱系的共同传播株具有更强的易感性。
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