新型冠状病毒（Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2）是一种正义单链RNA病毒，属于冠状病毒科。其基因组由多个片段组成，总长度约2.9万个核苷酸。新冠病毒引起的疾病称为2019冠状病毒病（coronavirus disease 2019, COVID-19），主要影响呼吸系统.临床症状包括发热、咳嗽、呼吸困难等，严重时可导致肺炎、急性呼吸窘迫综合征、出凝血功能障碍及多器官功能衰竭等。COVID-19的大规模流行对全球造成了巨大的生命和经济损失，并对全球公共卫生体系构成了前所未有的挑战。截至2025年2月23日，全球累计确诊病例已超过7.7亿例，死亡病例数高达709万（https://data.who.int/dashboards/covid19/cases?n=c）
自新冠病毒出现以来，已发现多种基因型和主要变异毒株。世界卫生组织对特定的可能影响病毒的传播能力、免疫逃逸能力或对疫苗的反应能力的变异株进行命名（https://www.who.int/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants），大致分为Alpha（B.1.1.7)、Beta（501Y.V2或B.1.351）、Gamma（P.1）、Delta（B.1.617.2）和Omicron（B.1.1.529）5种。
自2021年11月在南非首次发现以来，Omicron变异株经历了持续的变异与迭代，之后全球流行的变异株均是Omicron的后代，包括2022年广泛流行的BA.2和BA.5子谱系、2023年广泛流行的XBB以及当前占据主要地位的JN.1及其子谱系。Omicron变异株S蛋白上积累了大量的突变，尤其是在受体结合域上的关键氨基酸变异，可能增强了病毒与宿主细胞受体结合能力，提升了病毒的传播力。随着Omicron在全球的广泛传播，许多亚谱系在受体结合域表现出趋同突变模式，这些突变可能对病毒的传播能力、免疫逃逸潜力以及致病性产生了一定影响。
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