流感嗜血杆菌是一种革兰氏阴性球杆菌，常见于儿童和成人中。其能够无症状定植于上呼吸道，通过呼吸道扩散，进而引发侵袭性感染。
流感嗜血杆菌包括有荚膜（Hi，血清型a-f）和无荚膜不可分型（NTHi）菌株。过去，b型荚膜流感嗜血杆菌（Hib）是主要的致病血清型，可导致脑膜炎和败血症等侵袭性疾病。直到20世纪80年代末/90年代初，多糖荚膜疫苗的广泛使用，使Hib在建立了儿童免疫计划的国家中几乎消失。然而，疫苗的接种同时促进了NTHi和非b型血清型菌株的出现，使其成为现今流感嗜血杆菌相关侵袭性疾病的主要病原菌。
NTHi是健康个体上呼吸道常见定植菌，可引发多种急性或慢性呼吸道感染，包括儿童中耳炎、结膜炎、鼻窦炎及下呼吸道感染；成人慢性阻塞性肺病和囊性纤维化急性加重；以及新生儿、免疫功能低下者和老年人的败血症。
基因组水平上Hi菌株的克隆群有限，而NTHi菌株则存在很高的基因组多样性。NTHi可以分为六个分支，V分支最常见（包含ST3、ST14、ST103 和 ST139），其次是VI和II分支，I、III和IV较为罕见。流感嗜血杆菌致病过程中，毒力和定植因子是疾病发生的关键因素。其中，嗜血杆菌黏附穿透蛋白(Hap)、 high molecular weight proteins 1和2 (HMW1/HMW)、流感嗜血杆菌粘附素/嗜血杆菌表面纤毛（Hia/hsf）以及菌毛蛋白Hif均参与细胞黏附过程。编码唾液酸化四糖单元的hmg（可增强细菌对宿主免疫杀伤的抵抗能力）与II、III、IV 和 VI分支相关。调控磷脂酰乙醇胺相位变异表达并影响细菌血清抗性的lpt3基因与V分支相关。
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