金黄色葡萄球菌（S. aureus）是一种革兰氏阳性菌，也是人类最重要的机会性致病菌之一，在全球范围内导致很高的发病率和死亡率。金黄色葡萄球菌可定植于20-30%人群的鼻腔中，同时也可在皮肤、咽喉、腋窝、腹股沟和肠道等部位定植。定植本身通常无害，但却是继发感染的重要风险因素，其临床表现可从轻度的皮肤和软组织感染到严重的侵袭性感染不等，包括骨髓炎、化脓性关节炎、菌血症或败血症、肺炎以及心内膜炎。
除了具有多样的临床表现外，金黄色葡萄球菌能够对几乎所有的抗生素产生耐药性。金黄色葡萄球菌能够分泌一种名为生物膜的胞外聚合物，有助于细菌抵抗并最大限度地减少抗菌药物作用。尽管最初青霉素在治疗严重的金黄色葡萄球菌感染方面取得了革命性突破，但随着细菌获得编码β-内酰胺酶的blaZ基因，耐药性金黄色葡萄球菌迅速传播。金黄色葡萄球菌通过mecA基因获得葡萄球菌青霉素耐药性，导致耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）多个谱系在全球传播，MRSA现已成为全球公共卫生领域的一大威胁。目前，糖肽类药物已成为治疗侵袭性MRSA感染的主要治疗手段。
社区获得性MRSA（CA-MRSA）和医院获得性MRSA（HA-MRSA）具有不同的基因型和表型特征。例如，HA-MRSA对多种抗生素具有很强的耐药性，而CA-MRSA对抗生素更敏感，毒性更强。耐药性及毒力因子的传播主要通过可移动遗传元件的水平基因转移及突变介导。通过SCCmec基因盒分型和Panton-Valentine leukocidin toxin基因的存在与否可区分HA-MRSA和CA-MRSA菌株。然而，随着这两种类型菌株的分子特征和流行病学特征的日益趋同，明确的区分界限已逐渐消失。在医疗机构中，CA-MRSA正在逐渐取代传统的HA-MRSA菌株。
除人类外，MRSA已成功在牲畜及伴侣动物中站稳了脚跟，拓宽了宿主范围并形成了新的病原体储存库。MRSA的流行病学特征和种群结构存在显著的地理差异。特定的高风险MRSA谱系已在世界各地传播，并在MRSA相关感染中呈流行势态，且不同谱系在不同地区、不同时间呈现优势流行特征。
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[1] Lowy F D. Staphylococcus aureus infections[J]. N Engl J Med, 1998, 339(8): 520-32.
[2] Wertheim H F, Melles D C, Vos M C, et al. The role of nasal carriage in Staphylococcus aureus infections[J]. Lancet Infect Dis, 2005, 5(12): 751-62.
[3] Turner N A, Sharma-Kuinkel B K, Maskarinec S A, et al. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus: an overview of basic and clinical research[J]. Nat Rev Microbiol, 2019, 17(4): 203-218.
[4] Howden B P, Giulieri S G, Wong Fok Lung T, et al. Staphylococcus aureus host interactions and adaptation[J]. Nat Rev Microbiol, 2023, 21(6): 380-395.
[5] Peng H, Liu D, Ma Y, et al. Comparison of community- and healthcare-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates at a Chinese tertiary hospital, 2012-2017[J]. Sci Rep, 2018, 8(1): 17916.
[6] Otto M. Community-associated MRSA: what makes them special?[J]. Int J Med Microbiol, 2013, 303(6-7): 324-30.
[7] Burrus V, Waldor M K. Shaping bacterial genomes with integrative and conjugative elements[J]. Res Microbiol, 2004, 155(5): 376-86.
[8] Lakhundi S, Zhang K. Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus: Molecular Characterization, Evolution, and Epidemiology[J]. Clin Microbiol Rev, 2018, 31(4): e00020-18.
[9] Petinaki E, Spiliopoulou I. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus colonization and infection risks from companion animals: current perspectives[J]. Vet Med (Auckl), 2015, 6: 373-382.